Kai psichinis ligonis Cole yra siunčiamas laiku atgal į 1996-1997 metus, kad rastų informacijos apie mirtiną virusą, kuris sunaikins 5 milijardus žmonių, ji per klaidą patenka į 1990-uosius ir patenka į psichiatrinę ligoninę, kur jį apklausia daktarė Kathryn Railly.

1996-aisiais Cole pagrobia medikę ir pasinaudoja ją, kad rasti "12 beždžionių" - revoliucionierių grupuotę, kuri planuoja paskleisti virusą pasirinktuose miestuose.

Tapęs paieškomu dėl pagronimo ir žmogžudystės, Cole atsisako grįžti į ateitį, nes įsimyli Railly.